Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A4Q9Y6R1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A4Q9Y6R1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms