Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USH1CQ9Y6N9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USH1CQ9Y6N9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USH1CQ9Y6N9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USH1CQ9Y6N9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USH1CQ9Y6N9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USH1CQ9Y6N9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USH1CQ9Y6N9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USH1CQ9Y6N9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USH1CQ9Y6N9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USH1CQ9Y6N9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms