Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAD1L1Q9Y6D9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms