Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP20Q9Y6A4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP20Q9Y6A4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms