Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCAF1Q9Y4C2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCAF1Q9Y4C2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCAF1Q9Y4C2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCAF1Q9Y4C2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TCAF1Q9Y4C2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCAF1Q9Y4C2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms