Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REXO2Q9Y3B8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
REXO2Q9Y3B8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms