Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COQ4Q9Y3A0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COQ4Q9Y3A0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ4Q9Y3A0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms