Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIKFYVEQ9Y2I7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIKFYVEQ9Y2I7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIKFYVEQ9Y2I7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms