Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCA2Q9UQC9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCA2Q9UQC9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCA2Q9UQC9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms