Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN6Q9UQ52 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN6Q9UQ52 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN6Q9UQ52 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms