Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
TRAK1Q9UPV9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRAK1Q9UPV9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRAK1Q9UPV9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms