Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IQSEC3Q9UPP2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IQSEC3Q9UPP2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IQSEC3Q9UPP2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IQSEC3Q9UPP2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms