Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AP4E1Q9UPM8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AP4E1Q9UPM8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms