Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP8AP2Q9UKL3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP8AP2Q9UKL3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP8AP2Q9UKL3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CASP8AP2Q9UKL3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CASP8AP2Q9UKL3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP8AP2Q9UKL3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms