Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD2

TBK1, Serine/threonine-protein kinase TBK1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBK1Q9UHD2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TBK1Q9UHD2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBK1Q9UHD2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBK1Q9UHD2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms