Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AFF4Q9UHB7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AFF4Q9UHB7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms