Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
IFT172Q9UG01 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
IFT172Q9UG01 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
IFT172Q9UG01 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms