Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS7AQ9UBW8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPS7AQ9UBW8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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