Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NXF1Q9UBU9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXF1Q9UBU9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms