Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRPC4Q9UBN4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRPC4Q9UBN4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms