Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR35Q9P2L0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR35Q9P2L0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR35Q9P2L0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.6 ms