Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCOR3Q9P2K3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RCOR3Q9P2K3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms