Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MARCH4Q9P2E8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MARCH4Q9P2E8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms