Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP36Q9P275 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP36Q9P275 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP36Q9P275 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms