Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCHIP1Q9P0W5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCHIP1Q9P0W5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms