Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SENP1Q9P0U3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SENP1Q9P0U3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SENP1Q9P0U3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms