Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC59Q9P031 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms