Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GGA3Q9NZ52 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GGA3Q9NZ52 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms