Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM53CQ9NYF3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM53CQ9NYF3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms