Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MKS1Q9NXB0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms