Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJC28Q9NX36 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms