Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO28Q9NVF7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO28Q9NVF7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO28Q9NVF7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms