Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM39AQ9NV64 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM39AQ9NV64 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM39AQ9NV64 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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