Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC39A9Q9NUM3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC39A9Q9NUM3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms