Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GINM1Q9NU53 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GINM1Q9NU53 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GINM1Q9NU53 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms