Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
RRP7BPQ9NSQ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms