Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSBQ9NSD9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FARSBQ9NSD9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FARSBQ9NSD9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms