Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD18Q9NS91 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAD18Q9NS91 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD18Q9NS91 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms