Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS45Q9NRW7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS45Q9NRW7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms