Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTL1Q9NRR1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYTL1Q9NRR1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms