Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SDR39U1Q9NRG7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms