Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SH2B1Q9NRF2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SH2B1Q9NRF2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms