Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DUOX1Q9NRD9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX1Q9NRD9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX1Q9NRD9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX1Q9NRD9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX1Q9NRD9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX1Q9NRD9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX1Q9NRD9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DUOX1Q9NRD9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DUOX1Q9NRD9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
DUOX1Q9NRD9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DUOX1Q9NRD9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DUOX1Q9NRD9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms