Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGEF3Q9NR81 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms