Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INCENPQ9NQS7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INCENPQ9NQS7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
INCENPQ9NQS7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms