Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PFDN4Q9NQP4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PFDN4Q9NQP4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms