Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
XPNPEP3Q9NQH7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XPNPEP3Q9NQH7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XPNPEP3Q9NQH7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms