Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASCL3Q9NQ33 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms