Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
A4GALTQ9NPC4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A4GALTQ9NPC4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A4GALTQ9NPC4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms