Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TREM1Q9NP99 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TREM1Q9NP99 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms